21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3834 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  100 
 
 
57 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  54.39 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  53.57 
 
 
55 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  53.57 
 
 
55 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  49.02 
 
 
55 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  53.7 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  51.85 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  50.91 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  51.85 
 
 
55 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  42.59 
 
 
52 aa  53.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  51.79 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  49.06 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  51.06 
 
 
58 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  48.94 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  48.15 
 
 
54 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4969  hypothetical protein  45.83 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553476  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4652  hypothetical protein  40 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  42.59 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0726  hypothetical protein  54.05 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509331  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4310  hypothetical protein  32.65 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0646462  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  43.18 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>