14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1411 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  45.36 
 
 
224 aa  177  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  41.24 
 
 
208 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  41.12 
 
 
206 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  41.75 
 
 
208 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  44.44 
 
 
197 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1535  hypothetical protein  42.42 
 
 
226 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  42.63 
 
 
206 aa  168  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  21.09 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  23.43 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  22.64 
 
 
209 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4366  hypothetical protein  27.1 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  21.43 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  25.79 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>