70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0947 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  350  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  50.3 
 
 
208 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  52.12 
 
 
191 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  52.98 
 
 
190 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  52.98 
 
 
190 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  48.43 
 
 
177 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  42.7 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  44.74 
 
 
210 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  44.94 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  36.99 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  42.2 
 
 
210 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  38.5 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  36.36 
 
 
218 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  36.72 
 
 
218 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  36.72 
 
 
218 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  34.07 
 
 
210 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  48.08 
 
 
218 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  30.97 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  44.33 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  34.34 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  34.64 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  32.37 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  28.26 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  34.48 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  31.13 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  33.77 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  32.56 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  32.56 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  33.54 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  30.28 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  30.2 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  34.18 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  38 
 
 
146 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  32.39 
 
 
160 aa  57.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  32.61 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  30.08 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  30.08 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  26.77 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  29.41 
 
 
210 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  28.67 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  31.09 
 
 
208 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  27.97 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  37.8 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  27.97 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  27.74 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  27.73 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  27.82 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  27.12 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  27.14 
 
 
175 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  30.65 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  36.05 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  34.75 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  30.61 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  30.07 
 
 
171 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  45.83 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  34.33 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  28.37 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  32.84 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  35.56 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0633  hypothetical protein  28.37 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  37.31 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  40.3 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  24.38 
 
 
397 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  27.4 
 
 
176 aa  42  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  25.95 
 
 
168 aa  41.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  29.41 
 
 
174 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  31.25 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  25.71 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>