15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0744 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0744  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0200822  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0470  hypothetical protein  52.17 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.652133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0476  hypothetical protein  52.17 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.288807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0584  hypothetical protein  52.38 
 
 
61 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000268362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  51.22 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  51.16 
 
 
50 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  53.66 
 
 
54 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  46.51 
 
 
46 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  50.98 
 
 
54 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  50.98 
 
 
54 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  48.94 
 
 
54 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  51.02 
 
 
56 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  51.02 
 
 
56 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  46.34 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0645  hypothetical protein  42.86 
 
 
46 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>