19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0531 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  71.7 
 
 
55 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  67.92 
 
 
55 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  67.92 
 
 
55 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  67.92 
 
 
55 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  69.81 
 
 
66 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  69.81 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  67.92 
 
 
55 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  67.92 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  56.6 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  52.83 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  48.15 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  49.06 
 
 
56 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0726  hypothetical protein  58.33 
 
 
80 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509331  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  45.28 
 
 
54 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  47.17 
 
 
52 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5552  hypothetical protein  46.15 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.423548  normal  0.0424308 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  43.4 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  42.59 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>