13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2796 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2796  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.434133  normal  0.0812431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0753  hypothetical protein  50.3 
 
 
172 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.590626 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2431  hypothetical protein  39.26 
 
 
168 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0307  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.341519 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5945  hypothetical protein  33.08 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4950  hypothetical protein  29.1 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1518  hypothetical protein  28.32 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614963  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1405  hypothetical protein  23.93 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0704578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0827  hypothetical protein  24.81 
 
 
314 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0508348  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3252  hypothetical protein  26.28 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00156633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0404  hypothetical protein  32.54 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.825315  normal  0.0195046 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0812  hypothetical protein  24.06 
 
 
322 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000531799  normal  0.0257293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1048  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>