18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1680 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1680  RNase P subunit p30  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2528  RNase P subunit p30  46.98 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1824  RNase P/RNase MRP subunit p30-like protein  44.12 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.824867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1343  hypothetical protein  37.27 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.116204  hitchhiker  0.00147591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2280  RNase P/RNase MRP subunit p30-like  34.58 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0194  ribonuclease P protein component 3  29.49 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00291251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3310  Ribonuclease P  30.28 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1367  RNase P subunit p30  30.99 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  27.23 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0526  Ribonuclease P  30.99 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1704  Ribonuclease P  28.84 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1427  ribonuclease P  27.95 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2397  Ribonuclease P  28.37 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1415  ribonuclease P  24.38 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.586306  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1207  ribonuclease P  24.84 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0481  ribonuclease P  26.81 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0960  RNase P subunit p30  28.05 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1310  ribonuclease P  24.6 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.104784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>