15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0946 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0946  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.055779  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1339  hypothetical protein  56.77 
 
 
269 aa  323  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.435415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1859  Protein of unknown function DUF439  54.72 
 
 
266 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0107  hypothetical protein  54.04 
 
 
273 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0358  hypothetical protein  34.72 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0387819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0252  Protein of unknown function DUF439  28.24 
 
 
287 aa  72  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.839895  hitchhiker  0.00882976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0939  Protein of unknown function DUF439  29.17 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.833029  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0987  Protein of unknown function DUF439  26.84 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2860  Protein of unknown function DUF439  25 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1628  Protein of unknown function DUF439  23.43 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826009  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1721  hypothetical protein  23.15 
 
 
348 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0559114  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0255  hypothetical protein  21.95 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0181  hypothetical protein  23.65 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2266  Protein of unknown function DUF439  22.09 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0310035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0741  hypothetical protein  22.66 
 
 
348 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>