23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0488 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0488  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.105289  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2327  hypothetical protein  55.24 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.808055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1203  Protein of unknown function DUF128  53.97 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2599  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1751  hypothetical protein  40.33 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000678533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  37.86 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  39.68 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  32.63 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  36.1 
 
 		 324 aa  149  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  33.33 
 
 		 330 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  31.17 
 
 		 350 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  33.87 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  31.6 
 
 		 350 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  31.17 
 
 		 350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  32.31 
 
 		 536 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  32.75 
 
 		 536 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  28.82 
 
 		 545 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  31.88 
 
 		 536 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  32.74 
 
 		 317 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  29.41 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  26.89 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  27.92 
 
 		 322 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  26.11 
 
 		 536 aa  86.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>