18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5552 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5552  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.423548  normal  0.0424308 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  81.82 
 
 		 56 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  46.3 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  48.08 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  40.74 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  45.45 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  46 
 
 		 52 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  38.89 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4652  hypothetical protein  47.27 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659155  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4969  hypothetical protein  43.64 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553476  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  45.83 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  35.29 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4969  hypothetical protein  38.89 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.689573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  43.75 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  45.83 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4310  hypothetical protein  38.18 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0646462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  46.15 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  39.22 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>