29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5187 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  90.23 
 
 		 293 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  67.05 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  60 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  60.85 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  42.03 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  41.61 
 
 		 288 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  40.93 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  41.5 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  44.31 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  41.61 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  39.1 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  43.28 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  43.57 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  37.45 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  37.3 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  37.3 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  35.21 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  35.48 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  37.6 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  35.53 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  36.96 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  32 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  30.12 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  30.18 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  29.41 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  27.68 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  26.88 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>