46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4816 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  933    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  71.33 
 
 		 455 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  51.99 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  51.99 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  48.47 
 
 		 360 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  47.63 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  44.44 
 
 		 364 aa  292  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  43.61 
 
 		 364 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  44.72 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  41.64 
 
 		 362 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  44.66 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  41.88 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  43.42 
 
 		 362 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  40.5 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  42.72 
 
 		 381 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  41.53 
 
 		 370 aa  246  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  42.02 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  40.5 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  40.68 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  39.38 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  39.38 
 
 		 364 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  38.87 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  37.5 
 
 		 358 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  38.59 
 
 		 359 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  35.22 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  30.66 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  29.43 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  27.17 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  31.81 
 
 		 401 aa  147  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  33.05 
 
 		 355 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  31.85 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  33.55 
 
 		 401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  32.05 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  32.15 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  27.97 
 
 		 343 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  29.91 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0973  hypothetical protein  51.24 
 
 		 136 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  38.54 
 
 		 133 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  40.86 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1482  hypothetical protein  35.63 
 
 		 126 aa  57  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  38.75 
 
 		 128 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  38.75 
 
 		 128 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  35.87 
 
 		 127 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4741  peroxidase  24.17 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198593  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  30 
 
 		 321 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>