15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4670 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4301  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  168  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.368926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4670  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  167  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4819  hypothetical protein  95.24 
 
 		 84 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  0.27545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3986  hypothetical protein  76.19 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00087868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0685  hypothetical protein  75.71 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1756  hypothetical protein  74.29 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.886984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1241  hypothetical protein  56.34 
 
 		 87 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4329  hypothetical protein  58.57 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1126  hypothetical protein  56.34 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2379  hypothetical protein  56.52 
 
 		 88 aa  84.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1259  hypothetical protein  56.34 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4017  hypothetical protein  57.14 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2702  hypothetical protein  56.34 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0227124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1478  hypothetical protein  41.43 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0756  hypothetical protein  38.81 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>