23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2899 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 243 aa  487  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  98.35 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  87.65 
 
 		 243 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  58.44 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 241 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  54.39 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  42.06 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  39.07 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  39.27 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  38.43 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  37.73 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2717  hypothetical protein  37.74 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  35.44 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  30.88 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1375  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3658  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>