15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2617 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2338  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  340  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2617  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  340  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53059  normal  0.0347471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2293  hypothetical protein  94.89 
 
 		 176 aa  314  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0090  hypothetical protein  66.04 
 
 		 174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3019  hypothetical protein  42.17 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3900  hypothetical protein  37.14 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703088  normal  0.015774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2085  hypothetical protein  39.62 
 
 		 170 aa  97.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647658  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3612  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1694  hypothetical protein  38.3 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1847  hypothetical protein  39.64 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211856  normal  0.427536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0283  hypothetical protein  34.85 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0545419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  26.71 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  26.39 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  25.19 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.367183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>