32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2533 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2533  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2258  type IV pilus assembly PilZ  99.52 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2215  type IV pilus assembly PilZ  95.65 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4632  type IV pilus assembly PilZ  70.5 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5127  type IV pilus assembly PilZ  59.8 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3234  type IV pilus assembly PilZ  61.54 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2571  hypothetical protein  48.74 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2168  hypothetical protein  48.74 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136953  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5217  hypothetical protein  50.53 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2147  type IV pilus assembly PilZ  47.69 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3901  type IV pilus assembly PilZ  47.87 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3278  type IV pilus assembly PilZ  47.69 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3133  type IV pilus assembly PilZ  46.81 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1725  type IV pilus assembly PilZ  49.44 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2200  hypothetical protein  46.24 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2055  type IV pilus assembly PilZ  45.71 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1855  type IV pilus assembly PilZ  45.71 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0262273  normal  0.0162783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1043  type IV pilus assembly PilZ  41.4 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1935  type IV pilus assembly PilZ  35.45 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4427  type IV pilus assembly PilZ  38.76 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1075  type IV pilus assembly PilZ  37.37 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5681  hypothetical protein  33.15 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2643  type IV pilus assembly PilZ  33.15 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.615004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1802  type IV pilus assembly PilZ  30.05 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3033  type IV pilus assembly PilZ  32.34 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3257  type IV pilus assembly PilZ  32.34 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3224  type IV pilus assembly PilZ  30.54 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1695  type IV pilus assembly PilZ  30.73 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0558499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4163  type IV pilus assembly PilZ  38.64 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4015  hypothetical protein  29.05 
 
 		 243 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969553  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5084  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0293715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0235  type IV pilus assembly PilZ  28.77 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>