14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1228 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1228  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.400134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1099  hypothetical protein  95.6 
 
 		 159 aa  309  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1033  hypothetical protein  90.28 
 
 		 156 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3036  hypothetical protein  51.08 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3333  hypothetical protein  45.16 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5505  hypothetical protein  48.92 
 
 		 171 aa  133  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3850  hypothetical protein  44.22 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0802919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3295  hypothetical protein  32.88 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5604  hypothetical protein  30.32 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0168557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0447  hypothetical protein  31.97 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1389  hypothetical protein  32.89 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1132  hypothetical protein  31.69 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0544737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2969  hypothetical protein  23.68 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>