20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1889 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1889  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  100 
 
 
104 aa  214  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.475377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1510  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  46.81 
 
 
108 aa  88.6  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0219546  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0533  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  50 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000671955  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1485  hypothetical protein  44.33 
 
 
106 aa  87.4  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000525267  hitchhiker  0.00254885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1975  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  52.94 
 
 
105 aa  87  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.813085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3013  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  53.66 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1272  putative ribonuclease P subunit RPR2  40 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604634  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0214  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.08 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125403  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1734  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40.66 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0168  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.56 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.736645 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0728  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40.66 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.154027  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0560  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.36 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0421  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.79 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0943  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40.48 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1578  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40.51 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0671  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  30.93 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3200  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.33 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  45 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0746  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.29 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0240663  normal  0.0930395 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0089  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.18 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>