22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0242 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  59.18 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  56.7 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  51.04 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  42.42 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  51.35 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  42.86 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  45.68 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  35.35 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  46.91 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  46.91 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  40.45 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  38.2 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  43.24 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  35.96 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  33.71 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  34.83 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  32.58 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  36.36 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  34.12 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  29.17 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  32.93 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>