25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1751 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1751  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  498  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000678533  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  68.65 
 
 
252 aa  362  3e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  46.09 
 
 
271 aa  231  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1203  Protein of unknown function DUF128  41.91 
 
 
250 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2599  hypothetical protein  37.3 
 
 
248 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2327  hypothetical protein  38.27 
 
 
248 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.808055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0488  hypothetical protein  40.33 
 
 
248 aa  191  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.105289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  37.6 
 
 
323 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  38.93 
 
 
324 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  37.92 
 
 
350 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  37.08 
 
 
350 aa  175  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  36.69 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  42.34 
 
 
314 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  37.71 
 
 
350 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  37.04 
 
 
317 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  32.64 
 
 
316 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  31.97 
 
 
316 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  28.69 
 
 
545 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  31.43 
 
 
322 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  26.78 
 
 
536 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  26.78 
 
 
536 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  25.52 
 
 
536 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  24.8 
 
 
536 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1790  Ribonuclease R winged-helix domain protein  27.57 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1785  Ribonuclease R winged-helix domain protein  23.01 
 
 
374 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>