21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1272 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1272  putative ribonuclease P subunit RPR2  100 
 
 		 107 aa  220  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1510  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  46.6 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0219546  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  45.05 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3200  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  44.94 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1889  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.475377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1578  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  46.43 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1975  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  44.44 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.813085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0421  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  41.41 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0943  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.56 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0560  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.81 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0089  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.96 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0728  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  43.75 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.154027  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1734  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  42.71 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1485  hypothetical protein  34.31 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000525267  hitchhiker  0.00254885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0168  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  41.67 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.736645 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0214  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.58 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1998  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  43.33 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0296724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3013  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.35 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0533  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  37.89 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000671955  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0671  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  31.87 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0746  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  29.21 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0240663  normal  0.0930395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>