25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1076 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  58.64 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  45.43 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  37.12 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  37.58 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  36.65 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  37.5 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  37.5 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  38.16 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  37.17 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  38.06 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1751  hypothetical protein  37.6 
 
 		 252 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000678533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  38.67 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  37.45 
 
 		 252 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  34.8 
 
 		 536 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  34.48 
 
 		 536 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  34.48 
 
 		 536 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  33.54 
 
 		 536 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1203  Protein of unknown function DUF128  35.98 
 
 		 250 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2327  hypothetical protein  35.98 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.808055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0488  hypothetical protein  32.63 
 
 		 248 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.105289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2599  hypothetical protein  36.44 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  31.65 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1785  Ribonuclease R winged-helix domain protein  25.5 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1790  Ribonuclease R winged-helix domain protein  28.36 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>