27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0282 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 101 aa  202  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  66.3 
 
 		 102 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  51.69 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  43.69 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  47.19 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  44.12 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  47.19 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  47.19 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  42.57 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  42.86 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  43.69 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  40.45 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  41.57 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  38.64 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  40.2 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  40.82 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  42.86 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  43.33 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  42.05 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  38.2 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  35.23 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  35.63 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  32.95 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  31.33 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  33.72 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  29.63 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  31.87 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>