84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2745 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  100 
 
 
191 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  31.65 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.48 
 
 
184 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  27.33 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  25 
 
 
161 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  26.71 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.88 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.88 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.88 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.88 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.88 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.12 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  26.45 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  29.33 
 
 
175 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  26.45 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.22 
 
 
182 aa  57.8  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  26.83 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.83 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.83 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.83 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  26.83 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.83 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  26.83 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.35 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  31.55 
 
 
168 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.22 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.61 
 
 
207 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 
186 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.61 
 
 
207 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.61 
 
 
207 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  29.58 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  26.21 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  29.81 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  28.77 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  24.07 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  29.56 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  28.57 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.08 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  29.75 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  28.09 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  29.63 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  26.71 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  28.37 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  29.33 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  26.03 
 
 
172 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  29.53 
 
 
171 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  23.17 
 
 
201 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  24.66 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  21.95 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  26.71 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  27.78 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  21.95 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  27.22 
 
 
169 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  21.34 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  28.57 
 
 
164 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  26.83 
 
 
164 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  26.09 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  26.09 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  26.09 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  26.09 
 
 
164 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  28.57 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  22.94 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  28.57 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  28.57 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0480  hypothetical protein  25.3 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  25.31 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  25.32 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  27.67 
 
 
164 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  29.29 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  31.03 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  25.32 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  28.57 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  26.71 
 
 
172 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  22.54 
 
 
179 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  22.98 
 
 
171 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  25.64 
 
 
183 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  27.1 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  30.77 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  28.95 
 
 
168 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  25.32 
 
 
176 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  28.38 
 
 
173 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  25.32 
 
 
176 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  27.78 
 
 
168 aa  41.2  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>