25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0283 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  60.44 
 
 		 100 aa  123  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  56.04 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  56.04 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  57.14 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  42.57 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  40 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  41.76 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  40.4 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  36.27 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  37.08 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  43.24 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  35 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  35.56 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  30 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  30.77 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  32.63 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  29.7 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  30.77 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  31.18 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  29.9 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  30 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  30.61 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>