Gene MCAP_0828 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMCAP_0828 
Symbol 
ID3828354 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007633 
Strand
Start bp957622 
End bp959688 
Gene Length2067 bp 
Protein Length688 aa 
Translation table
GC content17% 
IMG OID637823977 
Productmetallo-beta-lactamase superfamily protein, putative 
Protein accessionYP_424775 
Protein GI83319950 
COG category[R] General function prediction only 
COG ID[COG2333] Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) 
TIGRFAM ID[TIGR00361] DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGAAAAATA TTAAGTTATT TATAATTGAT TTTTATAACT TTTTAGTATT AAAACACTAT 
TTTTTGTTGT TTTTATTATT AAGTATTTGT ATGAGTGCTA ATTTTATTTT AAATTTTAAT
TTTAATTATT TAATTTTAGC AATTTTCTTT TTAAGTTTAA CTATTATTTT AAATTACAAA
AATACTTTAA AAATACTTTT AATTTTTATT TCTATTAACT TAGTGTTTTT AGTATATATG
TTTTGGTTTA AACATTCTAA TTTAAGTTAT TTAAATAATA AAACTATTAT AAGTAGTGTT
ATTGATAAAA AAACTAATTA TGCTATTTTA CAACATAAAA ATATTAAGTT TTATATTAAT
GACTATAACA ATAAGTTTTT ATTAGATCAA ATAATAGAAA TATCTGGTGT GTTTAACAAA
TTAGAAAATA ATACTAGTTT TTATCAATTT GACTTTTTTA ACTATTTAAA CAAACAATTT
ATTGATTTTG AAATGATTAA TTATAAAGTA GAAAAAATTA GTAATGGGAT TAGAAGTAAT
TTTATTTTAA CTAATTATTT TTATACAAAC AAATTAGCTA GTATGTTTTT ATTTGAATCA
ATAGATAGAT CTACTAAGTT TGGTGAATTA ATAAAAGATT TGAATTTAAG TTTTTTAATA
GTTATTAGTA GTTATAACAT TCACTTTTTT ACTAAATTTT TTTATAAATT AAACACCAAA
TTTAAATGAA CAACAATAAT TACTTATTTA TTTTATTTAA TAGTTTTTTT ATTATCTTAT
TTAGCAAATT TTTCTTATGC TAGTTTAAGA ATAATAATTT TTTTTATTAT TAGTTTATAC
TTTAAAATAA CTAAAAAAAC TACTTTATTA GTTTTTAAAA GATTTTTAAC TCTTTTAATT
TGTTTTGTTT TAACTCCTAG TTTTTTAACT TCAAGTAGTG CTGTTTTTAT AATTGTTAGC
TTTATGTTTT ATTATGAAAA AATTTTTAGA AATAAATTTT TAGATTTATG TTTAAAATCT
TTAATTTTTA CTTTTTATTT TATTCCTTTA CAAATTTTTT ATTTTTATAG TTTTAGTATA
GTTATTCAAA GTTTATTAAT TGTTTTAAGA CCATTGTTTA GTTTTTTATA TTTTAGTATT
TTTATTTGAA TTTGGTTTGA TCATAATTTT TTAACTAATA TATTAATTAA GATTTTTGAG
TTTATTAAAA AGATTAATAT TAATTTTAAT ATAGGATATG TTAATGTTAT TTTTTTAATT
TTAGCTTATT TAATTATTTT AGTAATAATT AAATATAACT TTAAATCAAT ATGAAGTTGA
ATAAGTTTAA TTTTTATTTT GTTATTAAGT TATTTAATTA GTTGGTTAAT TAAACCAAGT
GTGTTTTTAG TAATGCTAAA TGTTGGTAAT GGTAATTGTT TTATTTTTCA TGATAAGTTT
AAAAACACAA CTATTATAAA TGATTGTGGA GTTGGAAAAG GTTTTTCTAA AAATATTGGT
TATGAGTTTT TAAAATATTT TGGTATTAAT CATGTTGATT TAATTATAAT TTCACACAAT
CATGCTGATC ATTATAATGC AATTGAAGCT ATTAGAAAAA ATATTAAAGT TTATGAAACA
ATTACTTATA ATAACTTTTT ACCTTTTAAA AGTATTAAAA ATGTAAATAT GTACTTTTTT
TGAAATAACT TAGAAAGTGA AAACGATAAA TCTTTAGTTT ATTTGTTTGA ATATAGAAAT
ATTAGAATTT TATTTACAGG AGATGTTGAA AAAGAAGCTG AACAATTATT AGTTAATAAT
GATTATTTTA AATACGTAGT CAATTTAAAG CCAATAGATA TTTTACAAGT ACCACACCAT
GGTTCTAATA CTAGTTCAAC TGATCAATTT ATTAGTTTAA TAAAACCAAA ATATGGATTA
GTATCAGGTA ATAAAAGAAC TTATAATTTT CCAAGATTTC AAACACTACA AACTTTATAC
AAACACAATG TTAAATATTT TATAAGTCAA ATTAATGGTA ATACTTTTTA TAATTTTTTA
ACTAATAGTT TTTGGTTTAA AAAATAA
 
Protein sequence
MKNIKLFIID FYNFLVLKHY FLLFLLLSIC MSANFILNFN FNYLILAIFF LSLTIILNYK 
NTLKILLIFI SINLVFLVYM FWFKHSNLSY LNNKTIISSV IDKKTNYAIL QHKNIKFYIN
DYNNKFLLDQ IIEISGVFNK LENNTSFYQF DFFNYLNKQF IDFEMINYKV EKISNGIRSN
FILTNYFYTN KLASMFLFES IDRSTKFGEL IKDLNLSFLI VISSYNIHFF TKFFYKLNTK
FKWTTIITYL FYLIVFLLSY LANFSYASLR IIIFFIISLY FKITKKTTLL VFKRFLTLLI
CFVLTPSFLT SSSAVFIIVS FMFYYEKIFR NKFLDLCLKS LIFTFYFIPL QIFYFYSFSI
VIQSLLIVLR PLFSFLYFSI FIWIWFDHNF LTNILIKIFE FIKKININFN IGYVNVIFLI
LAYLIILVII KYNFKSIWSW ISLIFILLLS YLISWLIKPS VFLVMLNVGN GNCFIFHDKF
KNTTIINDCG VGKGFSKNIG YEFLKYFGIN HVDLIIISHN HADHYNAIEA IRKNIKVYET
ITYNNFLPFK SIKNVNMYFF WNNLESENDK SLVYLFEYRN IRILFTGDVE KEAEQLLVNN
DYFKYVVNLK PIDILQVPHH GSNTSSTDQF ISLIKPKYGL VSGNKRTYNF PRFQTLQTLY
KHNVKYFISQ INGNTFYNFL TNSFWFKK