Gene MCAP_0504 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMCAP_0504 
SymboldnaG 
ID3828350 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007633 
Strand
Start bp601676 
End bp603490 
Gene Length1815 bp 
Protein Length604 aa 
Translation table
GC content20% 
IMG OID637823660 
ProductDNA primase 
Protein accessionYP_424477 
Protein GI83319946 
COG category[L] Replication, recombination and repair 
COG ID[COG0358] DNA primase (bacterial type) 
TIGRFAM ID[TIGR01391] DNA primase, catalytic core 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value0.188131 
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGGTATATA TAACAAATGA AAAAATTAAT GAAATCATTT CACAAGCTAA TATTGTTGAT 
ATAATTTCTT CTTATTTACA TCTAATTAAA AAAGGTAATA ATTACTTAGC TATTTGCCCT
TTTCATAATG ATTCAAACCC ATCATTAACG ATTTCACCAC AAAAAAGAAT TTATACTTGT
TTTAGTTGCA AAGCCACTGG AAATGTTATT AATTTTATAA AAGATTATGA GCATGTTGAT
TTTTTAACAG CTTTAAAAAC AGTGTGTGAA AAATCTAATA TACAACTTGA TGAATTAAAA
GATTTTCATC AGCCTATAAA AGATTTAGAA TCTGAAATGA TTTTGAAATT AAATTCTGAA
GCAAATGATA TTTTTAAAAC TACTTTATTT TCTAATTTAG GATCTAATGC TTTAGAATAT
TTAAAATCAA GAAATATTAG TATTGAAGAA ATTAAGAAAT TTGAAATTGG ATTTGCTAGT
GATAAAACAA ATTTAGTTCA AAAACTATTA GATAAAAATT ATAATAGCTT AGATATTGAA
AAAGCTAATT TAGGAATTAT TACTAATAGT TATAATAAAG ATTATTTTAT AAATAGAATT
ATTTTTCCAA TTAAAGATGA AAACAATCAT ATTATTGGAT TTAGTGGTCG AAGTTATACT
AAAGATAATG AACCTAAATA TTTAAATACC AAAGAAAATA AAGTTTTTAA AAAATCTCAT
TTAGCTTATA ACATAGCTAG TGCATTAAAA ATTAGTAAAG CTTTAAAACA AATAATTGTT
TTAGAAGGTT TTATGGATGT TATTAGTTTA AGTAGAATAG ATATTAATAA TACTATTGCT
TTAATGGGTA CTAGTTTATC TAATTATCAT CTTGAACTAT TTAAAAAACA CAATTTAGAA
GTTTTACTTT TTTTAGATGG TGATGATCCT GGAGTTCAAG CAAATATTAA AATTAGTCAT
CAATTATTAA AACAACAAAT TAATGTAAAG ATTATTGATA ATCAAACTAG TTATGATCCT
GATGAATTAA TTAATAATGA TCTTGAATAT CTTAAACAAA TTATTAATAA ACCCATTCAT
CCTATTAATT ATTTAATAGA AAAAAATTGA TCAAAAATTG ATATTAATGA TCCTAATCAA
ATTGAAGATT TTATTAAAAA AGTTTTGAGT TTTATAGTTG ATCTTAACAA CAATATATTA
ATTGAAAATA CTATTAAAAA ACTATGTGAA TTAACTAAAA TTTCAGAACA AACTATTAAA
AAAACTTTAG ATGAATTAAA AACTAAACTA AATAAACAAC AATTTAATAA AAATATTATT
AAAAAACCTT ACACTATTAA TAAACCTATT AGTAAAAAAA ATCCAGTTGA TTTTATTAAA
AAAGAATATA TTAATGCTGA ACAAAGAATT TTTGTTTCAC TATTAATAAG TAATCAATTT
TTAGATAAAA TCGCAGCTAA TGTTGAAAAG ATGATTCATC CAGACATTAA GTATGCAACA
ATTAATCTAA TTAATTTATA TAATAAAAAA ATTTATCAAG GAAATGATAT TAATAAAGCA
TTTGAACTAC TTAAAGAGTA TAATCTTACA GGCTTTGATA AAAAACAAGA AGAAATTATC
AATAATTCTT TAATAACACA AATAACAATT AAAGAATCTG AAATTGATGA TGCTTTTAAT
AAATTAGACT TATATCATAA ACATGCAGAA GTTTTAAATT TAAAAAAAAT GCTTGTTGAA
AGTAAAAATA AAACAGAGAG AATTCAAATC TGAAATGGAA TTGATACTCT GAAAAATAAA
AAGAAAAAGA GGTAA
 
Protein sequence
MVYITNEKIN EIISQANIVD IISSYLHLIK KGNNYLAICP FHNDSNPSLT ISPQKRIYTC 
FSCKATGNVI NFIKDYEHVD FLTALKTVCE KSNIQLDELK DFHQPIKDLE SEMILKLNSE
ANDIFKTTLF SNLGSNALEY LKSRNISIEE IKKFEIGFAS DKTNLVQKLL DKNYNSLDIE
KANLGIITNS YNKDYFINRI IFPIKDENNH IIGFSGRSYT KDNEPKYLNT KENKVFKKSH
LAYNIASALK ISKALKQIIV LEGFMDVISL SRIDINNTIA LMGTSLSNYH LELFKKHNLE
VLLFLDGDDP GVQANIKISH QLLKQQINVK IIDNQTSYDP DELINNDLEY LKQIINKPIH
PINYLIEKNW SKIDINDPNQ IEDFIKKVLS FIVDLNNNIL IENTIKKLCE LTKISEQTIK
KTLDELKTKL NKQQFNKNII KKPYTINKPI SKKNPVDFIK KEYINAEQRI FVSLLISNQF
LDKIAANVEK MIHPDIKYAT INLINLYNKK IYQGNDINKA FELLKEYNLT GFDKKQEEII
NNSLITQITI KESEIDDAFN KLDLYHKHAE VLNLKKMLVE SKNKTERIQI WNGIDTLKNK
KKKR