15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2651 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2651  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  279  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3226  hypothetical protein  86.29 
 
 
127 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000034976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3218  hypothetical protein  87.5 
 
 
131 aa  222  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.648594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0841  hypothetical protein  65 
 
 
135 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03910  hypothetical protein  64.17 
 
 
146 aa  154  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2070  hypothetical protein  50.4 
 
 
125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0817  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595251  hitchhiker  0.0010958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2838  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.584129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1307  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.478307  normal  0.112678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2067  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169668  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2763  hypothetical protein  38.71 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1242  hypothetical protein  38.71 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451086  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2598  hypothetical protein  38.71 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0236117  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2912  hypothetical protein  38.71 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.887727  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3625  hypothetical protein  26.55 
 
 
141 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>