84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2626 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  46.47 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  46.47 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  48.81 
 
 
169 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  44 
 
 
176 aa  151  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  46.43 
 
 
174 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  47.06 
 
 
169 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  47.67 
 
 
175 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  47.62 
 
 
167 aa  147  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  45.88 
 
 
169 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  45.29 
 
 
169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  45.51 
 
 
168 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  45.24 
 
 
168 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  45.29 
 
 
169 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  45.29 
 
 
169 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  46.15 
 
 
174 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  45.83 
 
 
169 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  45.83 
 
 
169 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  45.83 
 
 
169 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  45.83 
 
 
169 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  44.71 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  42.94 
 
 
174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  43.83 
 
 
163 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  44.31 
 
 
168 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  44.64 
 
 
169 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  42.35 
 
 
169 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  43.02 
 
 
208 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  45.86 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  43.37 
 
 
177 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  41.11 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  42.94 
 
 
177 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  41.99 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  44.25 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  44.65 
 
 
159 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  40.91 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  41.42 
 
 
175 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  43.64 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  51.4 
 
 
178 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  38.92 
 
 
177 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  37.58 
 
 
185 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  35.4 
 
 
186 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  40.48 
 
 
198 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  31.89 
 
 
197 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  31.89 
 
 
197 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  34.76 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  36.81 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  40.48 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  36.42 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  37.08 
 
 
182 aa  84.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  33.52 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  31.54 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  33.94 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  30.84 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  32.54 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  27.12 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  39.78 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  30.92 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  27.78 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  30.46 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  33.08 
 
 
159 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  27.37 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  24.62 
 
 
151 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  27.67 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  24.81 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  31.25 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  28.42 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  31.63 
 
 
186 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  31.63 
 
 
186 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  34.29 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  28.74 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  29.69 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  32.58 
 
 
171 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  27.14 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  33.85 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  26.6 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  26.45 
 
 
146 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  27.56 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  31.19 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  32.81 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  28.45 
 
 
186 aa  41.6  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>