13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1506 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1506  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1129    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0478439  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0956  hypothetical protein  61.84 
 
 		 560 aa  672    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1267  major facilitator superfamily permease  59.63 
 
 		 541 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.633668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  35.1 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  34.25 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  30.81 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35682  FBT family transporter: folate/pteridine  29.82 
 
 		 292 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  27.61 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  28.24 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  27.65 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  24.3 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  26.39 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  27.75 
 
 		 495 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>