20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0788 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  100 
 
 		 323 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  50 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  50.38 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  53.09 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  50.39 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  49.41 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  48.62 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  49.01 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  40.75 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  42.16 
 
 		 316 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  38.62 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  38.38 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  36.46 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  36.65 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  35.45 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  41.49 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  40 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  38.06 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  30.9 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  28.83 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.523701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>