24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03528 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03528  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  154  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000347587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3711  hypothetical protein  70.67 
 
 
80 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3952  hypothetical protein  60.53 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3709  hypothetical protein  59.74 
 
 
73 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0310  hypothetical protein  59.74 
 
 
73 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.351584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0315  hypothetical protein  58.44 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.90376  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4402  hypothetical protein  57.14 
 
 
74 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0319  hypothetical protein  55.84 
 
 
73 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0318  hypothetical protein  55.84 
 
 
73 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0314  hypothetical protein  55.84 
 
 
73 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0313  hypothetical protein  57.33 
 
 
73 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.487449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3449  hypothetical protein  57.33 
 
 
75 aa  77  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0417  hypothetical protein  54.55 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0330  hypothetical protein  51.95 
 
 
74 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3546  hypothetical protein  58.67 
 
 
73 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3405  hypothetical protein  59.21 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2598  hypothetical protein  52 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.103252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0608  hypothetical protein  52 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.51686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4248  hypothetical protein  50.67 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7172  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4619  hypothetical protein  48.1 
 
 
75 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0301  hypothetical protein  49.35 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.343727  hitchhiker  0.0000000789061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3910  hypothetical protein  46.05 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3431  hypothetical protein  54.67 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1037  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>