22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03446 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1178  hypothetical protein  67.31 
 
 
576 aa  783    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  68.59 
 
 
562 aa  785    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  100 
 
 
564 aa  1156    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  58.78 
 
 
555 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  55.25 
 
 
552 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  35.78 
 
 
599 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  36.63 
 
 
555 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  38.24 
 
 
565 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  38.55 
 
 
565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  38.55 
 
 
565 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  37.2 
 
 
560 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  34.55 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  33.33 
 
 
565 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  32.43 
 
 
574 aa  286  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07015  putative dipeptidyl-peptidase III  27.54 
 
 
671 aa  78.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3045  dipeptidyl-peptidase III  28.65 
 
 
706 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3161  hypothetical protein  23.39 
 
 
664 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2965  hypothetical protein  23.95 
 
 
668 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.711778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3053  hypothetical protein  23.26 
 
 
664 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  23.05 
 
 
886 aa  54.3  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2215  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
177 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0824414  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1280  invasion antigen B  26.41 
 
 
606 aa  44.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>