18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02511 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02511  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  205  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.441191  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2268  hypothetical protein  42.17 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0248  hypothetical protein  39.08 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.727714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5841  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67460  putative lipoprotein  41.98 
 
 		 85 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0369  putative lipoprotein  41.98 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5169  lipoprotein, putative  42.25 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0950  hypothetical protein  44.93 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0355  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0426  lipoprotein  40.85 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0510  hypothetical protein  41.79 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5038  hypothetical protein  38.36 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4912  hypothetical protein  38.36 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5088  hypothetical protein  38.36 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45630  hypothetical protein  37.21 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0311  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.49 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  25.81 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>