78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01852 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  100 
 
 		 174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  75.45 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  63.25 
 
 		 169 aa  227  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  54.97 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  55.69 
 
 		 169 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  54.49 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  53.89 
 
 		 176 aa  207  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  50.9 
 
 		 169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  50.9 
 
 		 169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  50.3 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  50.9 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  50.3 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  51.5 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  49.4 
 
 		 169 aa  190  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  52.41 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  51.19 
 
 		 168 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  48.81 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  49.4 
 
 		 168 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  47.62 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  47.09 
 
 		 175 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  44.05 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  46.54 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  44.23 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  45.66 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  43.35 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  42.07 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  41.46 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  39.31 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  37.21 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  46.43 
 
 		 198 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  42.94 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  41.51 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  39.63 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  40.23 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  42.38 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  44.53 
 
 		 196 aa  130  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  35.22 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  46.22 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  35.37 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  36.47 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  37.29 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  36 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  29.83 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  29.51 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.74 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  33.93 
 
 		 163 aa  90.9  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  32.12 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  29.85 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  29.27 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  28.48 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  36.17 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  29.94 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  47.37 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  29.51 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  27.87 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  30.69 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  25.62 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  26.23 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  26.81 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  27.08 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  23.33 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  24.71 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  26.25 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2326  Protein of unknown function DUF2062  28.24 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  24.59 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  30.59 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  27.62 
 
 		 159 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  24.59 
 
 		 160 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  24.59 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>