32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4427 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4427  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4163  type IV pilus assembly PilZ  77.61 
 
 		 200 aa  254  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5127  type IV pilus assembly PilZ  41.01 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3234  type IV pilus assembly PilZ  40.66 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2533  type IV pilus assembly PilZ  38.76 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2215  type IV pilus assembly PilZ  38.76 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2258  type IV pilus assembly PilZ  38.76 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2571  hypothetical protein  38.07 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0235  type IV pilus assembly PilZ  40.33 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4632  type IV pilus assembly PilZ  37.64 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1725  type IV pilus assembly PilZ  35.8 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3901  type IV pilus assembly PilZ  39.23 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2168  hypothetical protein  38.12 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136953  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5217  hypothetical protein  38.67 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2147  type IV pilus assembly PilZ  38.67 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3278  type IV pilus assembly PilZ  38.67 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3133  type IV pilus assembly PilZ  38.67 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2643  type IV pilus assembly PilZ  34.03 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.615004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2200  hypothetical protein  32.93 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1935  type IV pilus assembly PilZ  30.17 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5681  hypothetical protein  35.75 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2055  type IV pilus assembly PilZ  30.91 
 
 		 203 aa  97.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1855  type IV pilus assembly PilZ  30.91 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0262273  normal  0.0162783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1043  type IV pilus assembly PilZ  31.36 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1802  type IV pilus assembly PilZ  34.29 
 
 		 235 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4015  hypothetical protein  32.24 
 
 		 243 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969553  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1695  type IV pilus assembly PilZ  32.75 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0558499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3224  type IV pilus assembly PilZ  34.97 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3257  type IV pilus assembly PilZ  36.36 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3033  type IV pilus assembly PilZ  35.71 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1075  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5084  type IV pilus assembly PilZ  35.29 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0293715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>