28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3794 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  613  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  77.78 
 
 		 342 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  57.83 
 
 		 361 aa  325  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  57.51 
 
 		 374 aa  325  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  57.51 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  55.48 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  45.75 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  39.81 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  38.02 
 
 		 456 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  36.62 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  31.45 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  39.87 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  36.28 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  38.44 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  36 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  36 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  36.98 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  39.11 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  37.23 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  30.06 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.74 
 
 		 380 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  33.44 
 
 		 779 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.54 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  31.56 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  30.77 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  31.42 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  27.94 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>