25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1441 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  100 
 
 
236 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  69.1 
 
 
241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  54.39 
 
 
243 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  53.07 
 
 
243 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  55.14 
 
 
243 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 
244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  45.22 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  44.54 
 
 
238 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  43.67 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  43.81 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2717  hypothetical protein  42.22 
 
 
233 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  41.92 
 
 
238 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 
241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 
242 aa  131  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
236 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  33.97 
 
 
243 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  35.08 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
256 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1375  hypothetical protein  29.33 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  29.3 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3658  NUDIX hydrolase  28.88 
 
 
282 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0131  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0411  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
237 aa  45.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0714125  normal  0.0851261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>