22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0104 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4802  hypothetical protein  62.62 
 
 		 652 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.653605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0104  hypothetical protein  100 
 
 		 982 aa  1887    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1370  hypothetical protein  52.14 
 
 		 687 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.103555  normal  0.0562053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0272  hypothetical protein  53.28 
 
 		 669 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.937532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1570  hypothetical protein  51.14 
 
 		 654 aa  549  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0379435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1315  hypothetical protein  50.64 
 
 		 678 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3738  hypothetical protein  52.19 
 
 		 664 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4796  hypothetical protein  48.01 
 
 		 622 aa  413  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308009  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1296  hypothetical protein  36.14 
 
 		 791 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5538  cellulose synthesis protein  32.93 
 
 		 760 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1207  hypothetical protein  35.66 
 
 		 799 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.907173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5211  hypothetical protein  34.11 
 
 		 705 aa  192  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4801  hypothetical protein  38.36 
 
 		 345 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  91.3  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3737  hypothetical protein  36 
 
 		 348 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1571  hypothetical protein  34.26 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0271  hypothetical protein  35.03 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.283397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4795  hypothetical protein  42.28 
 
 		 326 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1316  hypothetical protein  33.51 
 
 		 335 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0965  hypothetical protein  27.72 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1975  hypothetical protein  29.69 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898955  normal  0.425307 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4176  hypothetical protein  27.72 
 
 		 458 aa  48.5  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>