22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0562 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0562  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.994142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3562  hypothetical protein  55.79 
 
 
100 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5102  hypothetical protein  52.63 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4833  hypothetical protein  52.63 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4691  hypothetical protein  52.63 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5069  hypothetical protein  52.63 
 
 
100 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4675  hypothetical protein  52.63 
 
 
101 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5109  hypothetical protein  52.63 
 
 
100 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5107  hypothetical protein  52.63 
 
 
100 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00264798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0131  hypothetical protein  51.09 
 
 
102 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.559712  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4789  hypothetical protein  50.53 
 
 
100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5198  hypothetical protein  54.76 
 
 
90 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3049  protein of unknown function DUF1027  54.76 
 
 
91 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2904  protein of unknown function DUF1027  54.76 
 
 
91 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0943  hypothetical protein  56.63 
 
 
127 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0924  hypothetical protein  56.63 
 
 
127 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0338061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0512  hypothetical protein  53.01 
 
 
129 aa  101  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0187  hypothetical protein  49.4 
 
 
255 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1661  hypothetical protein  43.82 
 
 
240 aa  97.1  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1321  hypothetical protein  30.54 
 
 
165 aa  94  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.401685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0457  hypothetical protein  48.75 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.922377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0443  hypothetical protein  30.49 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000176531  normal  0.574737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>