16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1228 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  55.15 
 
 		 196 aa  221  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  54.12 
 
 		 202 aa  217  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  53.37 
 
 		 202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  49.74 
 
 		 275 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  49.74 
 
 		 275 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  48.73 
 
 		 196 aa  201  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  43.88 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  43.81 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  36.81 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  39.01 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  30.39 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  31.87 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01360  hypothetical protein  23.81 
 
 		 187 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>