55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0643 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  31.61 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  30.11 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  30.51 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  30.68 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  31.14 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  31.1 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  30.54 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  27.93 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  26.55 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  37.76 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  27.37 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  30.59 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  36.73 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  30.64 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  27.12 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  30.77 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  29.03 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  30.17 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  36.43 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  27.22 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  30.73 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  32.63 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  28.09 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  24.57 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  31.48 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  24.71 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  24.14 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  25.58 
 
 		 159 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  32.99 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  30.51 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  27.17 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  31.63 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  28.48 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  23.53 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  32.63 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  29.86 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  28.49 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  26.74 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  25.29 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  25.29 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  27.91 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  22.73 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  25.28 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  23.39 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  22.67 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  24.71 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  34.12 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  25.29 
 
 		 169 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  24.14 
 
 		 228 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  24.71 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>