33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0618 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0458  rare lipoprotein B, putative  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0618  Rare lipoprotein B-like protein  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.18 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.59 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.87 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  28.08 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  28.29 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.54 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.54 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.54 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.95 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.83 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.42 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.42 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.42 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.42 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.33 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.95 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  24.68 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  24.68 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.68 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.68 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.95 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  24.68 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.68 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.68 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  26.32 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  27.92 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  27.92 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  31.53 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.83 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  29.52 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>