13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3883 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3883  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1986  hypothetical protein  34.65 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0936785  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2415  putative prolin-rich transmembrane protein  34.84 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1299  prolin-rich transmembrane protein  49 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.033846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2292  hypothetical protein  36.91 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29110  hypothetical protein  43.14 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2458  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2467  hypothetical protein  39.71 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.564543  normal  0.906023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3227  proline-rich transmembrane protein  39.5 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2584  putative prolin-rich transmembrane protein  35.96 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4707  hypothetical protein  38.71 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.813409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2304  hypothetical protein  35.48 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221973  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1579  hypothetical protein  28.23 
 
 		 185 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889797  normal  0.0471891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>