16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3657 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3657  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  316  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2946  hypothetical protein  79.87 
 
 		 155 aa  261  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.896453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0218  hypothetical protein  74.03 
 
 		 154 aa  251  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1626  hypothetical protein  75.97 
 
 		 154 aa  249  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0672235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0091  hypothetical protein  70.13 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1542  hypothetical protein  66.88 
 
 		 159 aa  213  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4554  hypothetical protein  66.01 
 
 		 155 aa  213  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0706007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2698  hypothetical protein  64.71 
 
 		 155 aa  208  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0894  hypothetical protein  63.4 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263402 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5125  hypothetical protein  43.45 
 
 		 184 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8468  hypothetical protein  34.64 
 
 		 185 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1698  hypothetical protein  32.3 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6975  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09009  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0094  hypothetical protein  35.82 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  44.64 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>