48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3556 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3556  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1562  hypothetical protein  61.64 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3393  hypothetical protein  56.95 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191739  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1829  hypothetical protein  57.96 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3492  hypothetical protein  55.77 
 
 		 214 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1843  hypothetical protein  56.55 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0703  hypothetical protein  39.24 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00895458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4472  putative lipoprotein  37.33 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0680  lipoprotein, putative  37.33 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5028  putative lipoprotein  38.06 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3866  hypothetical protein  40.4 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1036  hypothetical protein  46.53 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11280  hypothetical protein  46.53 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0505  putative lipoprotein  35.95 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0127462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0550  lipoprotein  35.29 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0540  hypothetical protein  35.95 
 
 		 177 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0558  lipoprotein  35.29 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  0.717571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06620  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5491  hypothetical protein  40.37 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0425  hypothetical protein  45.54 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71580  hypothetical protein  44.55 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5045  hypothetical protein  39.62 
 
 		 180 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.110017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00217  lipoprotein, putative  34.78 
 
 		 158 aa  88.2  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1814  hypothetical protein  31.71 
 
 		 189 aa  87.8  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0141  hypothetical protein  39.05 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6211  hypothetical protein  43.64 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2156  hypothetical protein  46.67 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0142  hypothetical protein  33.12 
 
 		 153 aa  85.1  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143516  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00771  hypothetical protein  41.58 
 
 		 164 aa  84.7  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0305  hypothetical protein  31.28 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001702  hypothetical protein  40.78 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01230  hypothetical protein  36.6 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3430  hypothetical protein  35.67 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5619  hypothetical protein  36.77 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1973  hypothetical protein  29.77 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2133  hypothetical protein  28.96 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5241  hypothetical protein  39.86 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  0.106495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5333  hypothetical protein  39.86 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5382  hypothetical protein  40.58 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0115  hypothetical protein  42.86 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2285  hypothetical protein  39.09 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3013  hypothetical protein  33.87 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4181  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0303  hypothetical protein  27.03 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.965134  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05705  hypothetical protein  26.46 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3621  hypothetical protein  34 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2155  hypothetical protein  46.05 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4728  hypothetical protein  34.09 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>