66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3037 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  100 
 
 		 147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  51.37 
 
 		 152 aa  151  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  36.23 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  39.31 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  35.21 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  35.51 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  34.51 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  32.39 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  33.86 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  31.29 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  35.97 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  34.72 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  34.51 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  32.19 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  27.4 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  34.27 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  27.4 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  26.71 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  31.69 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  32.54 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  28.06 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  32.35 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  31.62 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  31.25 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  31.51 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  27.45 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  28.06 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  27.03 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  27.97 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  28.06 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.86 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  30.23 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  29.2 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  28.57 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  29.2 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  27.05 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  27.81 
 
 		 176 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  28.07 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  28.76 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  27.27 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  27.05 
 
 		 178 aa  47.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  30.99 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  27.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  28.81 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  29.84 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  27.97 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  28.45 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  26.12 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  28.46 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  27.21 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  30.53 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  25 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  27.64 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  27.92 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  29.51 
 
 		 147 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  29.46 
 
 		 151 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  27.94 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  23.84 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  26.5 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>