17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1428 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  396  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  67.36 
 
 		 202 aa  267  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  63.73 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  60.82 
 
 		 275 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  61.14 
 
 		 275 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  58.16 
 
 		 196 aa  234  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  54.08 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  55.15 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  55.15 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  49.74 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  47.94 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  46.67 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  44.75 
 
 		 176 aa  164  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  36.22 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1213  hypothetical protein  26.58 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01360  hypothetical protein  24.18 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>