18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0314 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0314  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  869    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1964  hypothetical protein  55.81 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2975  hypothetical protein  54.73 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0496469  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2717  protein of unknown function DUF1688  55.4 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.970888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2662  protein of unknown function DUF1688  54.67 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0729613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3258  hypothetical protein  53.63 
 
 		 405 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5191  hypothetical protein  55.64 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.296322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5280  hypothetical protein  55.64 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5572  hypothetical protein  55.64 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3986  hypothetical protein  52.39 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0466  protein of unknown function DUF1688  50.46 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33081  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2167  hypothetical protein  44 
 
 		 427 aa  353  5e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4220  protein of unknown function DUF1688  48.66 
 
 		 432 aa  352  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2195  hypothetical protein  43.76 
 
 		 427 aa  349  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2103  hypothetical protein  48.43 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4571  hypothetical protein  49.29 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  hitchhiker  0.00903491 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00820  conserved hypothetical protein  39.1 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08797  conserved fungal protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09640)  36.83 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.199708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>