9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0308 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2305  hypothetical protein  45.16 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1706  hypothetical protein  45.35 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1185  hypothetical protein  44.44 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3203  hypothetical protein  46.37 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0184  hypothetical protein  39.59 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0910  hypothetical protein  41.92 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.406985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7383  hypothetical protein  33.51 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00987658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5424  hypothetical protein  29.81 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>